تغییرات زیاد در کادر فنی و سیستم مدریتی از دلایل اصلی افت پرسپولیس به حساب می آید.

با تمدید قرارداد دستیاران برانكو در پرسپولیس  مشخص شد زلاتكو ایوانكوویچ فصل آینده نیز روی نیمكت سرخپوشان خواهد نشست. برادر برانكو كه یك دوره سابقه حضور ناموفق در فوتبال ایران را در كارنامه دارد و اواسط دهه هشتاد برق شیراز را به دسته پایین‌تر فرستاد، در میانه‌های لیگ شانزدهم جانشین سرتن چوك شد تا دستیار اول برادرش لقب بگیرد. جابه‌جایی زلاتكو با چوك درست با دوران افت پرسپولیس مقارن شد تا برانكو بابت این انتخاب تحت فشار قرار بگیرد.

در این میان مساله روابط فامیلی و «ژن خوب» مطرح شد؛ ابهاماتی كه سرمربی سرخپوشان را هم عصبانی كرد. برانكو یك بار در واكنش به این این سوال كه آیا جدایی پانادیچ و چوك باعث افت پرسپولیس شده، با لحنی عصبی به خبرنگاران گفت: «یعنی منظورتان این است كه من كاره‌ای نیستم و تیم را دستیاران سابقم به موفقیت رساندند؟» طبیعی است كه با این مدل پاسخگویی، كسی دیگر جرات نمی‌كند لااقل به طور مستقیم از برانكو در مورد نقش برادرش در تیم سوال كند؛ نفشی كه به نظر می‌رسد چوك و پانادیچ آن را بهتر ایفا می‌كردند.