تغییرات زیاد در کادر فنی و سیستم مدریتی از دلایل اصلی افت پرسپولیس به حساب می آید.

با تمدید قرارداد دستیاران برانکو در پرسپولیس  مشخص شد زلاتکو ایوانکوویچ فصل آینده نیز روی نیمکت سرخپوشان خواهد نشست. برادر برانکو که یک دوره سابقه حضور ناموفق در فوتبال ایران را در کارنامه دارد و اواسط دهه هشتاد برق شیراز را به دسته پایین‌تر فرستاد، در میانه‌های لیگ شانزدهم جانشین سرتن چوک شد تا دستیار اول برادرش لقب بگیرد. جابه‌جایی زلاتکو با چوک درست با دوران افت پرسپولیس مقارن شد تا برانکو بابت این انتخاب تحت فشار قرار بگیرد.

در این میان مساله روابط فامیلی و «ژن خوب» مطرح شد؛ ابهاماتی که سرمربی سرخپوشان را هم عصبانی کرد. برانکو یک بار در واکنش به این این سوال که آیا جدایی پانادیچ و چوک باعث افت پرسپولیس شده، با لحنی عصبی به خبرنگاران گفت: «یعنی منظورتان این است که من کاره‌ای نیستم و تیم را دستیاران سابقم به موفقیت رساندند؟» طبیعی است که با این مدل پاسخگویی، کسی دیگر جرات نمی‌کند لااقل به طور مستقیم از برانکو در مورد نقش برادرش در تیم سوال کند؛ نفشی که به نظر می‌رسد چوک و پانادیچ آن را بهتر ایفا می‌کردند.